Παρουσίαση/Προβολή

(BIOL355) -  Ανδρέας Σκορίλας

Περιγραφή Μαθήματος

Σκοπός του μαθήματος είναι η παροχή γνώσεων στους τομείς της Βιοστατιστικής και της Πληροφορικής, τόσο από άποψη ανάλυσης αποτελεσμάτων συγκεκριμένων διαγνωστικών διαδικασιών, όσο και από πλευράς άντλησης δεδομένων από εξειδικευμένες τράπεζες πληροφοριών. Σήμερα, η ραγδαία ανάπτυξη των Βιολογικών επιστημών και οι πολλαπλές εφαρμογές τους στην Ιατρική, συνοδεύονται και έχουν συνδυαστεί με την αντίστοιχη αλματώδη ανάπτυξη της Πληροφορικής, καθιστώντας έτσι απαραίτητη τη γνώση των βασικών αρχών και δυνατοτήτων υπολογιστικών συστημάτων, καθώς και της ορθολογιστικής χρήσης του Διαδικτύου.

Ο εν λόγω κύκλος μαθημάτων περιλαμβάνει τις εξής θεματικές ενότητες:

• Η Βιοστατιστική στην Κλινική Bιοxημεία. Επιλογή και μέγεθος αντιπροσωπευτικού στατιστικού δείγματος, τυχαιοποίηση. Βιολογική μεταβλητότητα, η έννοια των φυσιολογικών τιμών
• Διαγνωστικοί δείκτες. Μέθοδοι συνδυασμού μοριακών δεικτών - ανάλυση
  ROC. Επιδημιολογικοί και ιατροδημογραφικοί συντελεστές
• Βασικές αρχές της Bιοπληροφορικής. Βάσεις δεδομένων (είδη, δοµή, ειδικός  σχολιασµός). Δίκτυα υπολογιστών, διαδίκτυο (internet), σύντοµη αναφορά στο πακέτο προγραµµάτων Office, οι δυνατότητες του Excel στη στατιστική ανάλυση. Μηχανές αναζήτησης βιβλιογραφικών δεδοµένων, καθώς και δεδοµένων αλληλουχιών DNA, RNA και πρωτεϊνών (data mining). Πεδία εφαρµογών
• In silico ανάλυση Ανάλυση αλληλουχιών DNA µέσω διαδικτύου. On line εργαλεία ανάλυσης. Σύντοµη παρουσίαση προγραµµάτων προσδιορισµού εκκινητών PCR. Εντοπισµός οµοιοτήτων σε αλληλουχίες DNA. Στατιστικός έλεγχος των προγραµµάτων αναζήτησης BLAST και FASTA. Ολική και τοπική στοίχιση, εντοπισµός µοτίβων αλληλουχιών
• Οι τεχνικές µήτρας Needleman & Wunsch και Smith & Waterman. Η λογική του τρόπου ελέγχου της στατιστικής σηµαντικότητας µιας στοίχισης. Το πρόβληµα της βαρύτητας των εξαλείψεων. Πολλαπλή στοίχιση αλληλουχιών, διαδικτυακοί τόποι και τοπικά προγράµµατα (CLUSTAL). Απεικόνιση βαθµού οµοιότητας στοιχησµένων αλληλουχιών.Το πρόγραµµα MEGA2
• Βασική στατιστική επεξεργασία αναλυτικών δεδομένων. Σφάλματα στην αναλυτική διαδικασία, αξιολόγηση ακρίβειας και ορθότητας μετρήσεων. Χημειομετρία και αναλυτική διαδικασία. Βαθμονόμηση. Χαρακτηριστικά ποιότητας αναλυτικών μεθόδων. Αξιοπιστία, ολίσθηση, ευαισθησία, ανιχνευσιμότητα, εκλεκτικότητα, διαχωριστότητα. Βελτιστοποίηση αναλυτικών μεθόδων
• Εισαγωγή στις πιθανότητες, τυχαία μεταβλητή, κατανομή τυχαίας μεταβλητής, παράμετροι κατανομής, διακριτές και συνεχείς τυχαίες μεταβλητές (διωνυμική, Poisson, κανονική), παράμετροι κατανομών (μέση
  τιμή, διασπορά)
• Κεντρικό οριακό θεώρημα, χρήση πινάκων πιθανοτήτων. Αριθμητικά παραδείγματα
• Βασικές αρχές στατιστικών δοκιμασιών
• Βασικές παραμετρικές στατιστικές δοκιμασίες (Student, Pearson, ANOVA).
• Ανάλυση διακυμάνσεων-δοκιμασία F. Εφαρμογές
• Βασικές μη παραμετρικές στατιστικές δοκιμασίες (χ 2 , Wilcoxon, Kruskal- Wallis, McNemar, Friedman, Spearman). Ανάλυση παλινδρόμησης.Εφαρμογές
• Ανάλυση Επιβίωσης: Κλινικοί πίνακες επιβίωσης – Ανάλυση επιβίωσης κατά Kaplan Meier. Εφαρμογές
• Μονομεταβλητή και πολυμεταβλητή ανάλυση επιβίωσης (Cox και λογιστική παλινδρόμηση). Παρουσίαση αποτελεσμάτων βιοστατιστικής ανάλυσης

Ημερομηνία δημιουργίας

Τετάρτη 13 Ιανουαρίου 2021